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[導(dǎo)讀] (文章來源:攜手健康網(wǎng)) 在VEGAS中發(fā)生的事情不會留在VEGAS中,如果同名系統(tǒng)實現(xiàn)了它的目的,那就不是:加速哺乳動物細胞中DNA序列的定向進化。VEGAS代表基因驅(qū)動序列的病毒進化

(文章來源:攜手健康網(wǎng))

在VEGAS中發(fā)生的事情不會留在VEGAS中,如果同名系統(tǒng)實現(xiàn)了它的目的,那就不是:加速哺乳動物細胞中DNA序列的定向進化。VEGAS代表基因驅(qū)動序列的病毒進化,它可以減少科學(xué)手段和新療法的開發(fā)。特別是,它可以避免常規(guī)形式的定向進化中常見的發(fā)育延遲,以及基于細菌細胞的方法所特有的缺點。VEGAS已被用于發(fā)展轉(zhuǎn)錄因子,G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)和來自美洲駝的納米抗體,以實現(xiàn)特定的體內(nèi)活性。這些概念驗證活動均在不到一周的時間內(nèi)完成。

這種新方法來自北卡羅來納大學(xué)(UNC)大學(xué),是一種相對快速,簡便且通用的方法,可以進行定向進化,這是自然選擇的人工版本。自從人們開始選擇和繁殖具有理想特征的動植物變種以來,它已經(jīng)使用了多個世紀(jì)。近幾十年來,定向進化已用于實驗室,生物學(xué)家在實驗室中努力產(chǎn)生有價值的分子。

VEGAS系統(tǒng)旨在更快地產(chǎn)生更多勝利。首先,它在哺乳動物細胞而不是細菌細胞中起作用。盡管細菌細胞通常是定向分子進化活動的便利平臺,但是許多理想的定向進化靶標(biāo)在單細胞背景下表現(xiàn)不佳或不自然。由于VEGAS在哺乳動物細胞中起作用,因此它可以用于進化新的人類,小鼠或其他哺乳動物蛋白質(zhì),而這些蛋白質(zhì)對于傳統(tǒng)的基于細菌細胞的方法而言將是繁重的或無法生成的。

而且,VEGAS系統(tǒng)使用RNA甲型病毒Sindbis作為待修飾基因的載體。這種帶有遺傳物質(zhì)的病毒可以感染培養(yǎng)皿中的細胞并迅速發(fā)生突變。

有關(guān)VEGAS的詳細信息顯示在7月4日的Cell雜志上,標(biāo)題為“ VEGAS,它是哺乳動物細胞中直接定向進化的平臺?!备鶕?jù)這篇文章,VEGAS為生物醫(yī)學(xué)工具和療法的定向進化提供了三大優(yōu)勢。VEGAS在宿主細胞的信號傳導(dǎo)框架內(nèi)進化。VEGAS完全依賴宿主細胞進行轉(zhuǎn)基因成熟VEGAS的選擇是恒定且高度誘變性的,從而使其能夠克服復(fù)雜健身環(huán)境固有的許多陷阱。

在他們的實驗中,研究人員設(shè)置了條件,以使能夠存活的唯一突變基因是編碼能夠在細胞內(nèi)完成所需功能(例如激活某種受體或開啟某些基因)的蛋白質(zhì)。一項實驗致力于修飾一種叫做四環(huán)素反式激活劑(tTA)的蛋白質(zhì),該蛋白可作為激活基因的開關(guān),是生物學(xué)實驗中使用的標(biāo)準(zhǔn)工具。通常,如果tTA遇到抗生素四環(huán)素或密切相關(guān)的強力霉素,它就會停止工作,但是研究人員開發(fā)了一個新的版本,具有22種突變,即使強力霉素水平很高,tTA仍然可以起作用。這個過程只花了7天。

科學(xué)家還將VEGAS應(yīng)用于一種常見的細胞受體GPCR。人類細胞上有數(shù)百種不同的GPCR,現(xiàn)代藥物將其作為治療多種疾病的靶標(biāo)。試圖創(chuàng)建更精確的治療方法的研究人員非常感興趣的是,當(dāng)給定的GPCR從非活動狀態(tài)變?yōu)榛顒訝顟B(tài)時,其形狀如何發(fā)生變化。English和同事使用VEGAS快速突變了一個研究較少的GPCR,稱為MRGPRX2,使其保持始終處于活動狀態(tài)。

“識別出在這種快速進化過程中發(fā)生的突變有助于我們首次了解受體蛋白質(zhì)中涉及向活躍狀態(tài)過渡的關(guān)鍵區(qū)域?!痹诹硪粋€演示中,該團隊展示了VEGAS在更直接地指導(dǎo)藥物開發(fā)方面的潛力。他們利用VEGAS快速發(fā)展了稱為納米抗體的小型生物分子,這些分子可以激活不同的GPCR,包括5-羥色胺和多巴胺受體,它們存在于腦細胞中,并被許多精神藥物所靶向。

該團隊現(xiàn)在正在使用VEGAS來努力開發(fā)高效的基因編輯工具,以潛在地治愈遺傳疾病,并設(shè)計出可以中和致癌基因的納米抗體。該研究的資深作者,UNC大學(xué)醫(yī)學(xué)院藥理學(xué)系杰出教授Michael Hooker表示:“科學(xué)界長期以來一直需要這樣的工具?!?“我們相信我們的技術(shù)將加速研究,并最終為患有許多我們需要更好治療的疾病的人們提供更好的療法。”
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