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[導(dǎo)讀]中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所陳暢研究組繼發(fā)現(xiàn)II型α亞型磷脂酰肌醇-4-激酶在腫瘤生長(zhǎng)中的作用(Oncogenes,2010)之后,與生物物理所孫飛研究組及伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校Klaus Schulten研究組合作,共同于3月28日

中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所陳暢研究組繼發(fā)現(xiàn)II型α亞型磷脂酰肌醇-4-激酶在腫瘤生長(zhǎng)中的作用(Oncogenes,2010)之后,與生物物理所孫飛研究組及伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校Klaus Schulten研究組合作,共同于3月28日在Nature Communications報(bào)道了關(guān)于人源II型α亞型磷脂酰肌醇-4-激酶(hPI4KIIα)的結(jié)構(gòu)功能研究成果Molecular insights into the membrane-associated phosphatidylinositol 4-kinase IIα,該研究成果從分子水平闡明了PI4KIIα激酶活性調(diào)節(jié)的分子機(jī)制。

PI4KIIα是磷脂酰肌醇信號(hào)通路和磷脂酰肌醇代謝中的關(guān)鍵分子,在PI(4,5)P2生物合成、溶酶體和高爾基體相關(guān)膜轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路傳導(dǎo)、病原體吞噬和神經(jīng)突觸囊泡循環(huán)等方面起著重要作用。PI4KIIα的功能異常與腫瘤生長(zhǎng)、痙攣性截癱、高雪氏癥和阿爾茨海默癥等人類疾病密切相關(guān),使得PI4KIIα成為了重要的潛在藥物靶點(diǎn)。生理?xiàng)l件下,絕大部分PI4KIIα?xí)蛔貦磅;揎棽⒍ㄎ辉诩?xì)胞內(nèi)膜上(主要為高爾基體膜和溶酶體膜),其激酶活性與棕櫚?;揎椕芮邢嚓P(guān)。此外,膽固醇、β淀粉樣肽等生物分子通過(guò)改變生物膜的動(dòng)態(tài)流動(dòng)性也可以調(diào)節(jié)其活性。然而,其分子調(diào)節(jié)機(jī)制由于沒(méi)有PI4KIIα的精細(xì)結(jié)構(gòu)一直沒(méi)有得到闡明。

該研究團(tuán)隊(duì)解析獲得了hPI4KIIα催化核心的ADP結(jié)合狀態(tài)的高分辨率晶體結(jié)構(gòu),揭示了PI4KIIα不同于PI3K家族蛋白的ATP結(jié)合口袋,為針對(duì)該潛在靶點(diǎn)的藥物設(shè)計(jì)提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ);與其它磷脂激酶催化核心相比,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)PI4KIIα具有三個(gè)獨(dú)特的插入片段——棕櫚?;迦肫危≒almitoylation insertion)、富含RK插入片段(RK-rich insertion)和插入片段3,PI4KIIα通過(guò)棕櫚酰化插入片段和富含RK插入片段與細(xì)胞膜的疏水和靜電相互作用緊密結(jié)合在細(xì)胞膜表面;同時(shí),基于分子動(dòng)力學(xué)模擬和生化分析手段,推測(cè)并驗(yàn)證了底物磷脂酰肌醇(PI)的結(jié)合口袋;更為重要的是,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬和進(jìn)一步的生化實(shí)驗(yàn)研究證明:膜環(huán)境的改變、棕櫚酰化修飾可以通過(guò)棕櫚?;迦肫蔚臉?gòu)象漲落來(lái)改變底物結(jié)合位點(diǎn)的穩(wěn)定性,從而調(diào)節(jié)PI4KIIα的激酶活性。

該工作展示了首個(gè)PI4K家族成員精細(xì)結(jié)構(gòu),揭示了一種新的磷脂激酶活性調(diào)節(jié)機(jī)理,為下一步發(fā)現(xiàn)該激酶的特異性抑制劑及靶向藥物奠定了基礎(chǔ),具有重要的生物學(xué)意義和應(yīng)用開發(fā)價(jià)值。孫飛研究組的碩博研究生周強(qiáng)軍博士(現(xiàn)為Stanford University博士后)和陳暢研究組的李江美博士為該文章的共同第一作者。與此同時(shí),陳暢研究組建立了以PI4KIIα與EGFR雙靶點(diǎn)聯(lián)合抗腫瘤新策略(Protein and Cell, 2014)。上述研究得到了科技部“973”計(jì)劃、“863”計(jì)劃和國(guó)家自然科學(xué)基金的資助。

圖a,hPI4KIIα催化核心ADP結(jié)合狀態(tài)整體結(jié)構(gòu);圖b,ATP結(jié)合口袋ADP與hPI4KIIα的相互作用;圖c,ATP結(jié)合口袋重要氨基酸殘基突變體激酶活性;圖d,基于分子動(dòng)力學(xué)模擬推測(cè)的PI結(jié)合口袋;圖e,棕櫚?;迦肫瓮蛔凅w激酶活性測(cè)定;圖f和g,hPI4KIIα沒(méi)有被棕櫚?;揎棧╢)和被修飾(g)情況下的氨基酸殘基構(gòu)象變化。

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