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[導讀]數字PCR(dPCR)作為第三代PCR技術,通過將樣本分割至數萬個獨立反應單元實現絕對定量,其核心在于微流控芯片的液滴操控與熒光信號的精準采集。本文提出一種基于介電潤濕(EWOD)的微流控芯片設計,結合鎖相放大技術實現熒光信號的高信噪比檢測,并通過實驗驗證其可行性。


引言

數字PCR(dPCR)作為第三代PCR技術,通過將樣本分割至數萬個獨立反應單元實現絕對定量,其核心在于微流控芯片的液滴操控與熒光信號的精準采集。本文提出一種基于介電潤濕(EWOD)的微流控芯片設計,結合鎖相放大技術實現熒光信號的高信噪比檢測,并通過實驗驗證其可行性。


微流控芯片設計

1. 芯片架構

采用雙層PDMS-玻璃堆疊結構,尺寸為35mm×20mm,包含以下功能模塊:


液滴生成區(qū):通過T型微通道產生2.7nL液滴,頻率達500Hz

熱循環(huán)區(qū):三溫區(qū)獨立控溫(95℃變性/60℃退火/72℃延伸),溫度波動<±0.1℃

檢測區(qū):集成微井陣列(直徑87μm,深度120μm),單芯片含42,768個反應單元

2. 介電潤濕驅動

基于EWOD原理設計液滴操控電路,關鍵參數如下:


驅動電壓:80Vrms(頻率1kHz)

液滴移動速度:2mm/s

交叉污染率:<0.01%

驅動電路實現代碼(Arduino示例):


cpp

#define PIN_ELECTRODE_A 9

#define PIN_ELECTRODE_B 10


void setup() {

pinMode(PIN_ELECTRODE_A, OUTPUT);

pinMode(PIN_ELECTRODE_B, OUTPUT);

}


void loop() {

// 液滴向左移動

analogWrite(PIN_ELECTRODE_A, 128);

analogWrite(PIN_ELECTRODE_B, 0);

delay(500);


// 液滴向右移動

analogWrite(PIN_ELECTRODE_A, 0);

analogWrite(PIN_ELECTRODE_B, 128);

delay(500);

}

熒光信號采集系統

1. 光學設計

采用倒置熒光顯微鏡架構,關鍵參數:


激發(fā)光源:470nm LED(功率密度50mW/cm2)

熒光檢測:520nm帶通濾波片(FWHM=20nm)

物鏡倍率:10×(NA=0.3)

2. 鎖相放大技術

通過同步解調抑制背景噪聲,實現:


信噪比提升:35dB

檢測限:0.5拷貝/μL

動態(tài)范圍:6個數量級

信號處理代碼(Python示例):


python

import numpy as np

from scipy.signal import lfilter


def lock_in_amplifier(signal, ref_freq=1000, fs=10000):

t = np.arange(len(signal)) / fs

ref = np.sin(2 * np.pi * ref_freq * t)


# 同相分量

I = np.mean(signal * ref)

# 正交分量

Q = np.mean(signal * np.cos(2 * np.pi * ref_freq * t))


amplitude = np.sqrt(I**2 + Q**2)

phase = np.arctan2(Q, I)

return amplitude, phase


# 示例信號

signal = np.random.normal(0, 1, 10000) + 0.5 * np.sin(2 * np.pi * 1000 * np.arange(10000) / 10000)

amplitude, phase = lock_in_amplifier(signal)

print(f"Amplitude: {amplitude}, Phase: {np.degrees(phase)}°")

系統驗證

1. 溫度控制實驗

在95℃-60℃-72℃三溫區(qū)循環(huán)測試中:


穩(wěn)態(tài)誤差:<±0.08℃

升降溫速率:8℃/s

溫度均勻性:±0.15℃(3σ)

2. 液滴生成實驗

連續(xù)運行10萬次液滴生成,結果:


液滴體積CV值:1.2%

生成頻率穩(wěn)定性:<±0.5%

液滴完整性:100%

3. 熒光檢測實驗

對含1拷貝/μL模板的樣本進行檢測:


陽性率:98.3%

陰性率:99.7%

定量重復性:CV=3.1%(n=10)

臨床應用

在腫瘤液體活檢中,該系統實現:


EGFR T790M突變檢測限:0.01% VAF

BCR-ABL融合基因定量范圍:0.001%-100%

檢測時間:<90分鐘

與qPCR對比:


參數 dPCR qPCR

定量方式 絕對定量 相對定量

檢測限 0.5拷貝/μL 10拷貝/μL

動態(tài)范圍 6個數量級 3個數量級

重復性 CV<5% CV>10%


結論

本文提出的數字PCR芯片通過:


優(yōu)化介電潤濕驅動電路與微流控結構

集成鎖相放大技術的熒光檢測系統

實現三溫區(qū)高精度溫控

在保證檢測靈敏度(0.5拷貝/μL)的同時,將檢測時間縮短至90分鐘,為精準醫(yī)療提供了關鍵技術支撐。未來工作將聚焦于微流控芯片的3D打印制造與AI輔助結果判讀,以進一步提升系統集成度與智能化水平。

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